参照东源县城历史数据，新港镇属亚热带季风气候，整体温暖湿润，但受水库与山地双重影响，体感较县城更为潮闷。

全年平均高温27℃、平均低温18℃，极端高温曾达38℃（2022年7月24日），极端低温-1℃（2023年12月24日）。

夏季（6‑8月）高温高湿，7月平均高温34‑35℃，且降水集中，月均雨日普遍超过15天，2025年7月单月降水高达1732毫米（约占全年一成以上）。

冬季（12‑2月）温和少雨，1月平均低温7‑9℃，但晴朗夜间的辐射降温可使库区周边出现轻霜。

春季（3‑5月）冷暖交替频繁，4月雨日增多，2024年4月雨日达21天、降水548.7毫米，常伴有强对流。

秋季（9‑11月）前期仍有台风间歇影响，9月雨日偏多（年均约13‑23天），10月起降水锐减。

因靠近万绿湖，新港镇全年水汽充沛，清晨湖面易起雾，冬季较县城更湿冷，夏季受湖面蒸发影响闷热感突出。